Церква св. Трійці один з найбільш давніх храмів міста. Перша згадка про храм відноситься до 1582 року, у зв'язку з передачею міщанкою Гапкою Табковою у власність Троїцької церкві своєї садиби.
У XVI-XVII ст. Троїцька церква була кафедральною. При ній жили намісники львівського православного єпископа.
В 1672 р. турки перетворили цей храм в мечеть Мустафи-Паші і зруйнували його після відступу.
В 1722 р. церква постала з руїн зусиллями уніатських монахів - Василіан, які заснували при ній монастир...
В 1795 р. Поділля з Кам’янцем було приєднано до Російської Імперії і Троїцька церква знову стала православною.
У 1935 році у рамках боротьби радянського уряду із релігією храм було розібрано.
В останні роки церква відновлена ченцями греко-католицького ордену Святого Василія Великого і з 10 липня 2010 р. діє як Храм Пресвятої Трійці Української Греко-Католицької Церкви.